Секвенатор Ion S5 Ion Torrent, 3-80 млн. прочтений, производительность 0,6-15 млрд.п.н., анализ от 5 ч

                                                                                                                                                                                                                     



Простой рабочий процесс для анализа панелей генов, микробных геномов, экзомов и транскриптомов.   

·         Принцип работы  — полупроводниковое секвенирование — встраивание нуклеотидов полимеразой, с детекцией протонов (Н+) в полупроводниковом микрочипе;

·         не требует применения красителей, лазеров, фотодетекторов;

·         точность анализа, % — 99,9;

·         полученные результаты обсчитываются серверной станцией;

·         длина рида, п.н. — 200 или 400;

·         длительность запуска — 2,5 ч (при длине рида 200 п.н.), 4 ч (при длине рида 400 п.н.);

·         количество прочтений, млн.:

— Ion 520 — 3-5;
— Ion 530 — 15-18;
— Ion 540 — 60-80. 

·         гибкая система чипов разной производительности, п.н.:

— Ion 520 — 0,6-1 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 1,2-2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 530 — 3-3,5 млрд. (при длине рида 200 п.н.), 6-7,2 млрд. (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 540 — 10-15 млрд. (при длине рида 200 п.н.). 

·         длительность анализа:

— Ion 520 — 5 ч (при длине рида 200 п.н.), 8 ч (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 530 — 8 ч (при длине рида 200 п.н.), 17,5 ч (при длине рида 400 п.н.);
— Ion 540 — 16,5 ч (при длине рида 200 п.н.). 

·         габариты, ШхГхВ, мм — 542×806×509;

·         вес нетто/ брутто, кг — 63,5/90,7.  

Особенности: 

·         менее 15 минут ручного труда для запуска секвенатора, менее 45 минут ручного труда для процедуры таргетного секвенирования от ДНК до результатов;

·         запуск секвенатора длится от 2,5 до 4 часов, от ДНК до результатов всего 24 часа;

·         небольшое количество стартового материала: 10 нг HK или РНК невысокого качества достаточно для получения полного списка мутаций или профиля экспрессии генов;

·         масштабируемость: один секвенатор для разнообразных экспериментальных задач, несколько форматов чипов для соответствия изменяющимся требованиям научных исследований.

Основные применения:

·         исследования рака: обнаружение химерных транскриптов в образцах тканей, исследование однонуклеотидных полиморфизмов (SNP), инсерций и делеций, изменения числа копий генов (CNV), уровней экспрессии генов, используя 10 нг FFPE ДНК или РНК.

·         исследования наследственных заболеваний: изучение мутаций, связанных с метаболизмом лекарст, секвенирование больших и малых панелей генов, обнаружение SNP, инсерции и делеции, а также CNV, связанных с редкими или неизвестными болезнями, с помощью полноэкзомного секвенирования;

·         исследования инфекционных заболеваний: идентификация и генотипирование микроорганизмов с помощью полногеномного секвенирования, определение мутаций, ответственные за устойчивость к антибиотикам;

·         исследование анеуплоидий: высокопроизводительное определение анеуплоидий и числа копий генов.

 

Аксессуары и опции: панели AmliSeq, наборы реагентов, чипы для секвенирования Ion 520Ion 530 и Ion 540

Вспомогательное оборудование: станция пробоподготовки Ion Chef, станция пробоподготовки OneTouch 2
термоциклеры; микроцентрифуга для чипов, микроцентрифуги, центрифуги-вортексы, вортекс, флуориметр Qubit 3.0; гомогенизатор,  системы препаративного электрофореза, магнитные штативы, источник бесперебойного питания, твердотельные термостаты, мембранный насос, пипетки, штативы. 

Комплект поставки, чипы, наборы. реагенты и расходные материалы — по запросу

Продукция

Обратиться к нашим специалистам